2020年最新非肿瘤miRNA干湿结合生信套路和相关数据库全总结,一看就会...
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长期流传的说法是肿瘤领域的生信研究相对容易，而非肿瘤研究则面临挑战。你们是否也有这样的感受呢？
事实上，非肿瘤研究虽有局限，如数据集不足且缺乏临床数据，但同时也提供了新的可能性。可以借鉴肿瘤研究的策略，用以攻克非肿瘤领域的难题。
这里分享一篇2020年发表在PeerJ的生信文章，探讨急性心肌梗死的miRNA标志物，IF值为2.353，期刊影响力持续上升。文章核心是理解miRNA在急性心梗中的作用。
生信研究中，miRNA和lncRNA等非编码RNA的研究同样重要，它们与mRNA分析类似，只是方法有所创新。作者巧妙地将干实验和湿实验结合，避免了纯生信研究可能面临的批评。
文章分为干实验和湿实验两部分。干实验部分包括挑选关键miRNA（Figure1-5，Table1-4）、联接预测的靶基因（Figure2，Table3）、功能聚类分析（Figure3-5，Table4）以及临床关联验证（Figure7）。
在挑选阶段，作者利用GSE数据集进行差异表达分析，并通过可视化展示。联接环节利用miRNA预测工具，如miRDB、RNAhybird等，形成预测网络。功能聚类（圈）部分使用了DAVID、WebGestalt等工具，而临床关联部分则通过ROC曲线评估诊断价值。
湿实验（Figure6）验证了miRNA在细胞模型中的表达，展示了实验设计、方法和结果。整体来看，文章展示了非肿瘤领域生信研究的一种可行策略，通过干湿结合展示了深入的分析过程。
希望这些信息能帮助你理解非肿瘤生信的研究路径，也鼓励你在自己的研究领域中尝试应用类似策略。更多细节可在“挑圈联靠”公众号获取，记得引用解螺旋·临床医生科研成长平台。
