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质粒,作为20世纪50年代初在大肠杆菌中的发现,是于染色体的闭合环状DNA,如今在基因工程中扮演着重要角色。它具备自主复制、可扩增、可转移及不相容性等特点,广泛应用于生物医药产品,如药物和疫苗开发。
质粒载体如pBR322,是最常用的一种,它有4361bp长,带复制起始位点和抗生素标记,能方便地克隆基因。pBR322的名称中,“p”代表质粒,BR来自两位研究者的名字,322是实验编号。其特点是:小分子量,专一复制,抗生素标记,高拷贝数。
构建质粒的原理是通过克隆技术,如酶切连接、Gateway、Golden Gate和Gibson等,将基因插入载体。首先,PCR扩增外源DNA,然后用酶切割载体和DNA片段,通过DNA连接酶将它们缝合。选择合适的克隆方法至关重要,如酶切连接法需要设计引物引入酶切位点,然后连接到宿主细菌,通过筛选获得重组克隆。
实验室中常见的构建方法有:传统酶切连接(依赖碱基互补配对),如T4连接酶用于连接平端或粘性末端;高通量的Gateway技术,适用于大片段基因克隆;LIC和SLIC技术则无需碱基互补,更高效;Gibson组装则通过一个体系完成酶切和连接,提高效率。
质粒构建流程包括:提取质粒,扩增目的基因,酶切处理,连接,转化宿主细胞,培养筛选。整个过程要求精确的酶切和连接,以及定向克隆策略,以确保目的基因在宿主细胞中的正确表达。
最后,质粒载体的制备需要考虑双酶切以避免自连,而目的基因片段的制备则依赖PCR扩增和引物设计。酶切连接时,需确保酶切产物的兼容性和连接效率,通过转化鉴定确保构建的成功。