转录组热图怎么看

发布网友 发布时间:2022-04-22 09:03

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热心网友 时间:2023-08-26 06:19

这个热图上你会得到两个信息,第一是表达量和颜色关系:

高原红就是高表达,原谅色就是低表达。当然,由于这个工具是聚类热图,所以左侧和顶上,会有聚类的树状图:

其实这个在GEO Analysis Tool里也能进行聚类,最常用的就是HCL分层聚类,怎么说呢,实际上就是按照表达的具体数值,用皮尔森法或者别的什么方法,比较基因或者样本之间的相似度。把表达模式相似的归为一类,有点像序列比对吧。

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