1、贷款利率不同
商贷5年以上基准利率是4.9%，公积金贷款5年以上利率是3.25%。假如我们贷款100万，30年，选择公积金贷款的月供是4352元，而选择商业贷款的月供是5307元。
2、贷款比例不同
虽说各地的贷款政策不同，但基本上公积金贷款比例都要低于商业贷款。例如同样一套房子，如果所在城市商业贷款是首套能贷7成，那么纯公积金贷款首套最多几乎都可以贷到8成。
3、贷款流程不同
申请商业贷款要在办理过户之前审核贷款，公积金贷款是在办理过户之后审核贷款，流程更为复杂一些。
4、审批时间不同
商业贷款批贷时间大约20个工作日，公积金贷款大约需要40个工作日，商业贷款要快于公积金贷款。
5、贷款来源不同
商业贷款放款来源主要是商业银行等放贷机构筹集的社会公众资金，而公积金房屋贷款则是公积金缉费者缴纳的资金。
6、使用人群不同
商业贷款针对所有符合条件的社会公众开放，而公积金贷款只对缴纳公积金职工开放。
7、利息用途不同
商业贷款的利息是商业行为的盈利，所得利息归相关的投资人，而公积金利息则是有政策规定用途，只能用于保障性住房建设。
8、审批机构不同
商业贷款主要通过银行审批，决定权在银行;公积金房贷需要通过公积金管理中心审批，决定权在公积金管理中心，银行只是执行机构。
9、年限和额度不同
不同银行和不同城市公积金管理中心规定不同，一般来说商业贷款可以选择的还贷期更长更灵活，额度也更高。
10、二套房政策不同
商业贷款对二套房贷的政策性限制更多一些，利率更高;而公积金贷款则受二套房贷的政策影响较商业贷款小，同样可以享受优惠利率。
住房公积金贷款利率与普通贷款利率差多少?
商业贷款利率如下：六个月以内(含6个月)贷款4.85%;六个月至一年(含1年)贷款4.85%;一至三年(含3年)贷款5.25%;三至五年(含5年)贷款5.25%;五年以上贷款5.40%。公积金贷款利率如下：个人住房公积金贷款五年以下(含五年)3.00%;个人住房公积金贷款五年以上3.50%。按照五年期的贷款利率计算5.4%-3.5%=1.9%，公积金贷款相对商业贷款少1.9个百分点。
不少购房者都有自己的公积金账户，但买房时或因账户余额较少或楼盘限制等因素而选择了商业贷款，所以后期为了减少房贷利息想转为公积金贷款，但其实商转公不一定划算，而且并非可以适合所有人。
1、看看你的还款剩余年限
如果你购房的商业贷款处于还款前期(如前两三年)，转为公积金贷款还是比较划算的，但如果已经是还款期限的后期，就没有商转公的必要了。
2、是否考虑提前还款
如果你打算在最近几年内提前还清购房所有贷款，也不用再去考虑办理商转公。事实上，商转公一般都要根据与原申贷银行的合同来走，征得原银行同意后可能还需要支付一定金额的罚金，再加上商转公过程中可能会产生的费用，最终也不一定划算。
3、是否准备公积金二次贷款
一般来说现在很少人买房可以做到一步到位，不少人未来都有改善住房的需求，但如果是二次贷款，公积金贷款额度上限的减少可能会增加你未来的置业压力，甚至影响未来的购房打算。所以对于能够承受商贷月供且很有可能二次置业的购房者，也不推荐办理商转公贷款。
4、部分区域二套房公积金贷款利率上浮
如果你名下有两套房子，并且商业贷款的利率是有折扣的，同样不建议你办理商转公。因为部分区域的城市二套房的公积金贷款利率要上浮10%。如果你二套房的商贷享受了一定额度的优惠，利率有可能比公积金利率更低。