土地使用权主体变更的办理首先应当取得出让方和城市规划行政主管部门的同意，之后签订合同即可办理。
1、取得出让方和城市规划行政主管部门的同意土地用途改变，将直接引起土地出让最高年限的改变和土地使用权出让金的变化。同时，土地用途的改变，必然发生土地使用权出让合同中规定的权利义务关系的变化。因此，《城市房地产管理法》第17条和《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第18条，都规定了土地用途的改变必须取得出让人的同意或批准。土地用途是城市规划的重要内容之一，改变后的土地用途必须符合城市规划的要求。因此，改变土地用途亦应取得城市规划行政主管部门的同意。
2、签订土地使用权出让合同变更协议或重新签订土地使用权出让合同土地用途的改变是土地使用权出让合同内容的重大变更，因此，土地用途的改变，在取得出让人和城市规划行政主管部门的同意之后，应由出让人和受让人签订土地使用权出让合同变更协议或者重新签订土地使用权出让合同，调整土地使用权出让年限，并相应调整土地使用权出让金。
一、需要提交的材料有哪些？
下列不同的情况，提交不同的材料：
(1)若抵押人与债务人不是同一人的，需提交抵押人同意提供抵押物给债务人进行抵押的合同或承诺书，合同或承诺书的内容包括被抵押的主债权的种类、数额、债务人履行债务的期限，抵押物的名称、数量、座落、用途、权属，抵押的范围、债务偿还的办法等，并由抵押权人见证；
(2)属集体企业抵押的，必须由上级政府或主管部门提出审查意见；属国有企业抵押的，必须由国有资产管理部门和上级主管部门提出审查意见。属集体和国有企业的，应有单位领导成员或代表大会集体讨论的书面意见(本款材料在抵押变更登记时抵押金额无增加的和债务人无变化的不需提交)；
(3)抵押物权属股份(合伙)制企业所有的，须经工商部门确认的董事或股东签名同意抵押的企业董事会书面批准意见，董事或股东的签名由抵押权人或市土地交易中心、国土资源分局、公证部门进行监证；
(4)属房地产开发的商住用地，必须提交市建设部门出具未办理销售商品房许可证的证明；属单位的住宅用地，必须提交市房改办或职工代表确认的未出售房地产的证明；若已办理房地产权证，必须提交房地产权证；已建有房屋，未办理房产权证的必须提交房管部门(或抵押人)未办理房产权证和房产抵押的证明(或承诺书)、房产来源的证明文件；
(5)以集体土地使用权抵押的，提交该集体土地所有者同意抵押的证明；
(6)对外抵押的需提交国家主管部门批准文件；
(7)土地使用权分割抵押的，应提交数字化测量的宗地图，抵押人和抵押权人分别在宗地图上盖章确认。由国土部门确定抵押土地的界线和面积。若分割抵押给同一个抵押权人，只填写一份申请表；若分割抵押给多个抵押权人的，应填写多份申请表。
(8)在本宗地内，部分土地已核发了房地产权证而未同时抵押，在办理未核发房地产权证的土地使用权抵押设定登记时，应提交数字化测量的宗地图，并经市房管部门在图上确认已核发房地产权证的范围。
(9)在本宗地内，部分土地已颁发了商品房预售许可证，在办理未核发商品房预售许可证的土地使用权抵押设定登记时，应提交数字化测量的宗地图，并经市建委在图上确认已颁发商品房预售许可证的范围。