没有租房合同编号不影响个人所得税的抵扣的，因为根据《个人所得税专项附加扣除操作办法（试行）》的规定，纳税人享受住房租金专项附加扣除需要填报主要工作城市、租赁住房坐落地址、出租人姓名及身份证件类型和号码或者出租方单位名称及纳税人识别号（社会统一信用代码）、租赁起止时间等信息即可。,法律依据：《个人所得税专项附加扣除操作办法（试行）》第十五条 纳税人享受住房租金专项附加扣除，应当填报主要工作城市、租赁住房坐落地址、出租人姓名及身份证件类型和号码或者出租方单位名称及纳税人识别号（社会统一信用代码）、租赁起止时间等信息；纳税人有配偶的，填写配偶姓名、身份证件类型及号码。
纳税人需要留存备查资料包括：住房租赁合同或协议等资料。