实行综合计算工时需要经过审批的。如果已经审批通过，那么是合法的。劳动部对企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制有相关规定，企业对符合条件的职工，可实行综合计算工时工作制，即分别以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。中国劳动法规定的工时制度有三种，即标准工时制、综合工时制和不定时工时制。
中国目前实行劳动者每日工作8小时，每周工作40小时这一标准工时制。有条件的企业应实行标准工时制。有些企业因工作性质和生产特点不能实行标准工时制，应保证劳动者每天工作不超过8小时、每周工作不超过40小时、每周至少休息一天。同样一个劳动者，同样存在超时加班的情况，因为实行不同的工时制，用人单位需支付的加班工资是不一样的。标准工时制度下，劳动者公休日加班的，用人单位需要支付不低于200%的加班工资。但是在综合计算工时下，即使在公休日加班，用人单位只需支付不低于150%的加班工资。
综合工时制适用的范围
1、交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等到行业中因工作性质特殊，需连续作业的职工;
2、地质及资源勘探、建筑、制盐、制糖、旅游等受季节和自然条件限制的行业的部分职工;
3、其他适合实行综合计算工时工作制的职工。
法律依据：
《中华人民共和国劳动法》
第三十六条 国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
第三十七条 对实行计件工作的劳动者，用人单位应当根据本法第三十六条规定的工时制度合理确定其劳动定额和计件报酬标准。
第三十八条 用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
第三十九条 企业因生产特点不能实行本法第三十六条、第三十八条规定的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法。