个税手续费返还的操作步骤如下：
1、企业必须是法定的扣缴义务人，按规定履行个人所得税的代扣代缴义务；
2、企业应具备健全的财务制度，便于税收控管和纳税，并能独立承担民事责任；
3、企业需有熟悉税收政策的专门办税人员；
4、企业应在法定期限内，如实报送代扣代缴、代收代缴税款报告表及税务机关要求的其他相关资料。
个税手续费返还的影响因素：
1、退还政策：不同地区的税务局可能有不同的退还政策，影响手续费返还的条件和额度；
2、缴纳情况：纳税人之前缴纳个税的金额和时间，可能会影响返还手续费的金额和流程；
3、申请材料：申请返还手续费所需提交的材料完整性和准确性，直接关系到返还流程的顺利进行；
4、审核流程：税务局的审核流程可能会因为工作量、人员配置等因素而有所不同，影响返还手续费的速度；
5、支付方式：返还手续费的支付方式（如银行转账、现金支付等），会影响纳税人收到返还款项的便捷性。
综上所述，个税手续费返还的操作步骤包括企业必须是法定的扣缴义务人，具备健全的财务制度，有熟悉税收政策的专门办税人员，并在法定期限内如实报送相关资料。
【法律依据】：
《中华人民共和国税收征收管理法》
第五十一条
纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还；纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还；涉及从国库中退库的，依照法律、行政法规有关国库管理的规定退还。