根据具体情况而定。自然灾害，如暴风、龙卷风、雷击、雹灾、暴雨、洪水、海啸、地陷、冰陷、崖崩、雪崩、泥石流、滑坡等灾害所造成车损，保险公司都会赔偿。如果在涉水时车突然熄火之后，驾驶人强行再次打火，致使发动机损坏的，保险公司是不负责赔偿的。
一、汽车自然灾害保险是否赔款
自然灾害造成的汽车损坏保险公司不一定赔。车损险规定，因雷击、暴雨、洪水、涝灾、海啸等造成损害，机动车的全部损失或部分损失，将由保险公司负责赔偿。涉水时车突然熄火之后，会强行再次打火，致使发动机损坏，这种情况保险公司不赔。
二、洪水冲掉的车子保险公司理赔吗
洪水冲掉的车子保险公司理赔。参照保险条款相关规定，暴雨、洪水、滑坡、泥石流等一般“自然灾害”造成的车辆损失属于商业车险中车损险的保险责任，保险公司会给当事人进行理赔。因此，如果当事人的车辆被洪水淹而导致的车辆直接损失，保险公司会依照保险合同的约定负责相应的赔偿。
三、车子招天灾损坏保险能赔吗
因为天灾导致车子损坏保险公司应该赔付。保险期间内，被保险人或其允许的合法驾驶员在使用被保险机动车过程中，因暴雨、洪水等自然灾害造成的被保险机动车的损失，保险公司将依照保险合同约定负责赔偿。如果汽车是停在小区或者地下车库中被水淹造成的损失，只要车辆投保了车辆损失险，保险公司都会按照自然灾害进行赔付。
【本文关联的相关法律依据】
《机动车车辆损失险保险条款》
第五条在本合同的保险期间内，因发生意外事故造成的保险车辆损失（以下称：保险车辆损失），本公司按照本合同的规定负责赔偿。
第六条发生保险事故时，被保险人对保险车辆采取施救、保护措施所支出的必要合理费用（以下称：施救费用），本公司按照本合同的规定负责赔偿。
第八条下列原因造成的任何人身伤亡和财产损失，本公司不负责赔偿：（一）地震、海啸；（二）战争、军事冲突、恐怖活动、暴乱、行政行为、司法行为；（三）核反应、核污染、核辐射；（四）欺诈；（五）被保险人的故意行为。