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酿酒酵母DNA复制起始区域识别方法[发明专利]

2021-02-08 来源:年旅网
专利内容由知识产权出版社提供

专利名称:酿酒酵母DNA复制起始区域识别方法专利类型:发明专利

发明人:杨润涛,吴峰,张承进,陈金桂,张丽娜申请号:CN201911184159.2申请日:20191127公开号:CN110890127A公开日:20200317

摘要:本申请提供了一种酿酒酵母DNA复制起始区域识别方法,包括:从酿酒酵母基因序列数据库中选取DNA样本;利用大小为3的滑动窗口以等距步长在DNA样本上进行滑动,得到核苷酸三联体集合;计算每个核苷酸三联体在核苷酸三联体集合中的频率;根据频率和核苷酸三联体的理化性质构建DNA样本的特征向量;将特征向量分别输入多个不同卷积层数的卷积神经网络,根据卷积神经网络的识别效果选择目标卷积层数;将设置有目标卷积层数的卷积神经网络进行超参数迭代,得到具有最优超参数的目标卷积神经网络;将待测酿酒酵母基因序列输入目标卷积神经网络,得到DNA复制起始区域。本申请提高了酿酒酵母DNA复制起始区域识别精度。

申请人:山东大学

地址:264209 山东省威海市文化西路180号

国籍:CN

代理机构:北京弘权知识产权代理事务所(普通合伙)

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