扣工资后全勤奖就没有了，全勤奖一般就是和工资一块发放，也就是说全勤奖作为工资的一部分，当月无论请事假或病假(不计时)，均扣除本月100%全勤奖。
当月在公司规定的上班时间内未出现任何迟到、早退、请假、旷工者，公司给予全勤奖。以上均由考勤卡计，按公司标准上班时间为准；市场部属自行考勤，不计发全勤奖，不服从安排怠工、息工、擅自离岗影响工作正常进行的扣除本月全勤奖。
全勤奖属于奖金，在工资单里应该是单独的一个项目，不能算在基本工资里一起扣的。工资只在两种情况下可以扣。首先，完不成绩效可以扣绩效工资；另外，由于员工原因造成单位经济损失，单位可以在员工工资里扣除，但每个月不超过20%。
一、请病假需要什么证明？
对于请病假需要向公司出具什么证明，法律上并没有明确规定。
具体要以单位合法的，经过程序的制度为准；单位有权依据制度规定病假需要提供的材料，以及审核材料，同时要求与员工随诊或复查。申请病假要符合单位程序性要求，并得到批准。但本人处于紧急情况，可以假后补正，或由家人代办。
任何企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，企业应该根据职工本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予一定的医疗期。
但是，病假并不完全等于医疗期。医疗期是《劳动合同法》规定了单位不能与劳动者解除劳动合同的法定保护时间。病假是医疗期的子集，请病假的时间都要纳入医疗期内。医疗期的长短按照本人社会工作年限和在本单位工作年限综合计算。
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